Na podstawie Rozporządzenia Rady Ministrów z dnia 15. czerwca 1999 r. została utworzona Państwowa Wyższa Szkoła Zawodowa w Krośnie (Dz. U. Nr 55, poz. 575). Wraz z tym faktem Minister Edukacji Narodowej powołał na rektora Uczelni prof. dr hab. Janusza Strutyńskiego. Prorektorem został prof. dr hab. inż. Andrzej Gonet, a kanclerzem mgr Franciszek Tereszkiewicz. Wówczas struktura Szkoły obejmowała dwa instytuty; tj. Instytut Humanistyczny i Instytut Wychowania Fizycznego. Dyrektorami powyższych instytutów odpowiednio byli dr Janusz Gruchała, prof. PWSZ i dr hab. Kazimierz Obodyński, prof. PWSZ.

W pierwszym roku swej działalności Uczelnia uzyskała zgodę MEN na kształcenie studentów na poziomie licencjackim na następujących specjalnościach:
Edukacja wczesnoszkolna, Język angielski, Język niemiecki, Język polski, Wychowanie fizyczne z gimnastyką korekcyjną i turystyką.
1 października 1999 r. 234 studentów studiów dziennych zainaugurowało nowy rok akademicki w pierwszej wyższej uczelni utworzonej w Krośnie.
W wyniku przeprowadzonych w 2000 r. wyborów władz Uczelni rektorem wybrano profesora Andrzeja Goneta, który na prorektorów zaproponował dra hab. Kazimierza Obodyńskiego, prof. PWSZ i dra Janusza Gruchałę, prof. PWSZ.
Po uzyskaniu zgody MEN na uruchomienie trzech nowych specjalności technicznych na studiach inżynierskich od nowego roku akademickiego tj. 2000/2001 zmieniła się struktura organizacyjna Uczelni i przedstawiała się jak poniżej:

Instytut Humanistyczny
Instytut Wychowania Fizycznego
Instytut Politechniczny

Oprócz już istniejących pięciu specjalności licencjackich rozpoczęto kształcenie na cieszących się dużym powodzeniem specjalnościach inżynierskich:
- Eksploatacja i konstrukcja maszyn,
- Kształtowanie środowiska,
- Sieciowe systemy informatyczne.

Władze Uczelni systematycznie czynią starania o rozszerzenie oferty kształcenia, które doprowadziły do uruchomienia w roku akademickim 2001/2002 kolejnych dwóch specjalności tj.:
- Gospodarka regionalna z agroturystyką - studia inżynierskie,
- Obsługa ruchu turystycznego i rekreacji - studia licencjackie, a w roku akademickim 2002/2003 specjalności Pielęgniarstwo na poziomie licencjackim.

Dopasowując strukturę organizacyjną do działalności dydaktycznej przekształcono Instytut Wychowania Fizycznego w Instytut Kultury Fizycznej i Gospodarki.

W roku akademickim 2004/2005 ponownie zmieniła się struktura organizacyjna Uczelni. Instytut Kultury Fizycznej i Gospodarki został przekształcony w dwie odrębne jednostki pod nazwami:
- Instytut Kultury Fizycznej,
- Instytut Gospodarki i Polityki Społecznej.

Obecnie Państwowa Wyższa Szkoła Zawodowa w Krośnie kształci na 11 kierunkach studiów:
- Budownictwo,
- Filologia,
- Filologia polska,
- Informatyka,
- Inżynieria Środowiska,
- Mechanika i budowa maszyn,
- Pielęgniarstwo,
- Pedagogika,
- Rolnictwo,
- Turystyka i rekreacja,
- Wychowanie fizyczne.